Сан-Франциско, 2015 год. Леон С. Кеннеди разыскивает похищенного инженера-робототехника, Клэр Редфилд исследует тушу погибшего от гигантского укуса кита, а Джилл Валентайн и Крис Редфилд расследуют странные случаи заражения Т-вирусом по всему городу. Единственное, что объединяет жертв, — все они недавно посещали тюрьму-музей Алькатрас. Отправившись туда на экскурсию, Клэр, Крис и Джилл оказываются в эпицентре вспышки вируса среди туристов.